中国农业科学院烟草研究所成立于1958年，是经国务院科学规划委员会批准、农业部设立的国家农业专业研究机构。1959年，经山东省人民委员会批准增名“山东省烟草研究所”。1987年，经国家科委、劳动人事部批准增名“中国烟草总公司青州烟草研究所”，实行以中国农业科学院为主的领导体制，是我国唯一的国家级烟草农业科研事业单位。研究所先后荣获中国农业科学院文明单位、山东省文明单位和农业部绩效考核优秀单位，所党委连续被评为中国农科院先进基层党组织和青岛市先进基层党组织。

研究所设有4个职能部门、8个研究中心和1个支撑服务部门，建有国家烟草改良中心、农业农村部烟草生物学与加工重点实验室、烟草行业烟草病虫害监测与综合治理重点实验室等19个国家和省部级科技创新平台，以及中美植物衰老联合实验室等3个国际合作平台，构建起以青岛所部为中心，青州所区、青岛试验基地、西南试验基地、宣城试验基地为支撑的“一所五地”发展布局。2018年，中国农业科学院青岛特种作物研究中心依托我所正式组建。

经过60年的建设与发展，研究所已成为学科齐全、专业人才集中、技术储备雄厚、优势突出、科技创新和成果转化水平较高的国家级烟草农业综合性研究机构。承担烟草遗传育种、栽培营养、植物保护、调制加工、生物技术、质量安全、植物功能成分、海洋农业等学科领域科研任务，在烟草功能基因组、病虫害绿色防控、低危害烟叶开发、“高香低害”品种选育、烟草功能成分综合利用等方面开展协同攻关，实现了国际首次烟草单倍体育种和体细胞杂交重大突破，保存烟草种质资源5767份居世界首位，参与构建了烟草全基因组图谱，建成了全球最大规模的烟草突变体材料库，构建了烟草全基因组模块化育种技术体系，初步建成了全国烟草病虫害绿色防控体系，建立了重金属消减技术体系、降焦关键技术体系和农药残留控制技术体系，开发了烟草主要功能成分提取及综合利用技术，拓展了烟草的新功能、新用途、新产品。1978年以来，共获得科技成果奖励185项，其中国家级奖13项，省部级奖109项。先后育成40多个国审烟草新品种。制修订国家和行业标准80余项，获授权国家发明专利107项、软件著作权66项。出版科技专著76部，发表学术论文4000余篇。

研究所始终坚持面向产区、服务三农，积极推动科技成果转化，参与策划5次全国烟叶生产现场会，共建了沪皖现代烟草农业高科技示范园、宣州现代功能农业科创园、四川凉山院企联创技术中心等科技研发平台，探索形成了湖北恩施“清江源山地生态烟开发”、山东诸城“精益生产”、安徽皖南“烟区现代农业”、四川凉山“原生态特色农业”等4种烟区现代农业发展模式。牵头构建了全国烟草品种区域试验网络、病虫害预测预报网络，在全国17个植烟省建立了85个核心科技示范园区，建立了覆盖全国烟区的服务“三农”支撑体系，常年有60余名专家深入烟叶生产一线开展技术服务和推广工作；与20多家省级烟草工商企业开展全面合作，在特色优质烟叶开发、原料保障体系建设、雪茄烟生产技术与品种培育、特征香韵突变体评价、新型烟草制品开发等领域开展了卓有成效的工作，为烟草行业创新发展和烟农持续增收提供了有力的科技支撑。

研究所现有在职职工192人。其中，专业技术人员173人，45岁以下专业技术人员占比70%。正高级职称30人，副高级职称61人；具有博士学位70人，硕士学位66人。享受国务院政府特殊津贴16人，农业部和山东省中青年突贡专家3人，国家公益性行业专项首席科学家1人，烟草行业学科带头人2人，中国农科院“农科英才”3人。2013年，研究所启动实施中国农业科学院科技创新工程，先后组建成立了烟草遗传育种、烟草功能基因组、烟草栽培与调制、烟草质量安全风险评估、烟草功能成分与综合利用、烟草病虫害防控、滩涂生物资源保护与利用7支创新团队。现有博士生导师11人，硕士生导师70人，培养出博士硕士研究生424人，年度在读研究生130余人。与西昌市人民政府、中国农业科学院研究生院共建了“中国农业科学院博士创新基地（西昌）”、“中国农业科学院研究生培养实践基地（西昌）”等人才培养平台，与青岛农业大学联合培养烟草专业本科生。

建立起博士后、博士、硕士、留学生、中外合作办学、国内联合培养、本科生联合办学等多层次、多方位的高等人才培养体系，为国家培养了一大批优秀高层次人才。建有博士后流动站和博士后工作站，常年在站博士后20余人。

展望未来，烟草所将按照习近平总书记提出的“面向世界农业科技前沿、面向国家重大需求、面向现代农业建设主战场”的战略要求，聚焦建设世界一流学科和一流科研院所的宏伟目标，秉承新发展理念，立足“一主体两拓展”发展定位，以科技创新工程为引领，以提升自主创新能力为核心，以推动科技成果孵化转化为重点，做精做强烟草主业，稳步向农业关键共性技术和功能农业领域拓展，在实施乡村振兴战略、推进行业创新发展和烟区功能农业发展中再立新功。