中国农业科学院生物技术研究所成立于1986年6月，其前身是生物技术研究中心，1999年更名为生物技术研究所,是目前我国唯一以农业生物技术前沿基础和应用基础研究为重点的国家级非营利性科研机构。挂靠我所的农业部农业基因组学重点开放实验室和农业部转基因植物用微生物环境安全监督检验测试中心是我国农业生物技术领域重要的研发基地。

研究所拥有7000平方米的实验区和1200平方米的实验温室，在海南三亚、河北廊坊和辽宁营口等地建立了田间试验基地，为功能基因大规模转化、作物分子育种、新品种培育及转基因生物安全性评价等工作提供了重要的硬件支撑。研究所现有在职职工144人，中国工程院院士1人，研究员44人、副研究员45人；博士生导师22人，硕士生导师32人；国家级“百千万人才工程”人选6人，国家“有突出贡献中青年专家”2人，国家杰出青年科学基金获得者2人，全国农业科研杰出人才4人，首都科技领军人才1人，中国农业科学院“农科英才”入选者20人。其中，45岁以下的中青年科技人才占62%。已经形成了一支老中青相结合，以年轻人为主，思维活跃，具有顽强拼搏精神和勇于创新的科研团队，现已成为我国农业生物技术领域的一支重要骨干力量。

研究所按照“夯实基础，自主创新；重点跨越，支撑发展；顶天立地，引领未来”的发展战略思路，瞄准国际发展前沿，针对国家重大需求，围绕作物和资源与环境两大学科集群，坚持植物和微生物的交叉与融合，在作物功能基因组、作物蛋白质组与代谢工程、作物分子育种技术、微生物功能基因组、微生物蛋白质工程和转基因生物安全评价与应用等六个优势研究领域内确立重点研究方向，系统开展前沿理论与前沿技术研究，取得了一系列重要创新成果。

“十二五”计划以来，研究所共承担973计划、863计划、国家自然科学基金、转基因重大专项等国家科技计划300余项。获得国家和省部级科技成果30多项，获得专利授权178项（其中国外专利5项），以转让的发明专利为核心技术而参股的公司有6家，注册资金超过1亿元，总资产超过2亿元；在国内外重要学术刊物上发表论文800多篇，出版专著30余部；审定品种14个，获安全生产证书80项，软件著作权6个，制定标准17项。

近年来，通过深化科研体制改革，研究所积极调整研究方向，努力优化专业结构，注重提升整体学术水平和科技创新能力，不断扩大在转基因农作物和重组微生物研究开发方面的优势，并在某些学科前沿上形成特色，着力把生物技术研究所建成国内一流、国际著名的农业生物技术研究所，成为国家农业生物技术科技创新中心、科技产业孵化中心、国际合作交流中心和人才培养基地。