中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所从事农产品质量安全科学研究和技术创新，以食用农产品及饲料为研究对象，开展农兽药和重金属等有毒有害物质残留动态、农产品质量安全溯源及真假识别等检测技术研究；开展农产品质量安全风险分析理论和关键技术、农产品种养殖过程质量安全控制技术等研究、农产品贸易技术壁垒预警体系建设及快速反应机制；开展国内外农产品质量安全标准研究与制修订；承担国家农产品及饲料质量安全风险监测、监督抽查等监控技术支持。

建所以来，研究所先后主持了国家重点研发计划、国家自然科学基金、《国家高新技术发展计划》（863）、国家科技支撑计划、国家国际科技合作项目、科技部基础性工作专项、科技基础条件平台、农业科技成果转化资金及公益性行业（农业）科研专项、引进国际先进农业科学技术计划（“948”）等各类国家或部门主体科技计划项目（课题），在《Food Chemistry》、《Journal of Agricultural and Food Chemistry》、《Analytical and Bioanalytical Chemistry》、《Analytical Chemistry》等食品及分析类一区期刊上发表多篇高水平论文，荣获北京市科学技术一等奖及中国农业科学院科技进步一等奖、杰出科技创新奖、青年奖等省部级奖项。

同时，研究所作为国家级农产品质量安全风险评估机构，在农产品质量安全例行监测、专项监测、风险监测、风险评估体系建设、饲料及畜产品质量安全监测、官方通报评议和舆情监测等方面开展了大量卓有成效的支撑服务工作，为农业部实现“两个努力确保”的总体目标做出了贡献。尤其是在建国60周年食品安全保障、“助奥行动”等重大活动和“三聚氰胺”、“瘦肉精”、“孔雀石绿”、“苏丹红”等违禁添加物突发事件查处和拉网检测中，发挥了巨大的作用，先后多次受到农业部和公安部的表彰，荣获农业部“助奥行动”先进集体称号。