中国农业科学院农田灌溉研究所1959年成立于北京，1963年迁到河南省新乡市,隶属农业农村部、水利部共同领导，三权归农业农村部。2009年11月，经中国农业科学院同意，河南省科技厅批准，加挂了“河南省灌溉排水技术研究所”的牌子。

现有职能部门4个、中国农业科学院农业科技创新工程科研团队7个、支撑部门4个，建有国家级科研平台1个、省部级科研平台6个、院级平台4个。

主要从事农田灌溉排水领域的应用基础研究和技术开发，研究方向主要包括灌溉技术与设备、排水技术与设备、作物-水关系及水分高效利用技术、农业水资源合理利用与水环境保护、农田生态系统物质和能量循环规律及高效利用技术等。建有农业水土工程学科博士、硕士学位授权点和农业水土工程博士后流动工作站。